Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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PRPF4BQ13523 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PRPF4BQ13523 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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