Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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TCIRG1Q13488 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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TCIRG1Q13488 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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TCIRG1Q13488 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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TCIRG1Q13488 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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TCIRG1Q13488 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCIRG1Q13488 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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