Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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