Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TCOF1Q13428 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TCOF1Q13428 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms