Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NME3Q13232 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NME3Q13232 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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