Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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IFT88Q13099 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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IFT88Q13099 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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IFT88Q13099 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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IFT88Q13099 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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IFT88Q13099 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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IFT88Q13099 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
IFT88Q13099 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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