Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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USP18Q9UMW8 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
USP18Q9UMW8 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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