Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
EHD3Q9NZN3 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms