Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TDP1Q9NUW8 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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TDP1Q9NUW8 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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TDP1Q9NUW8 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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TDP1Q9NUW8 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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TDP1Q9NUW8 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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TDP1Q9NUW8 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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TDP1Q9NUW8 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TDP1Q9NUW8 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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