Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TRAPPC6BQ86SZ2 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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