Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
RUNX3Q13761 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RUNX3Q13761 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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