Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms