Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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TOP3AQ13472 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TOP3AQ13472 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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