Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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