Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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TRAF1Q13077 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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