Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
MKRN3Q13064 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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