Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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FOXD4Q12950 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXD4Q12950 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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