Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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FOXO1Q12778 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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FOXO1Q12778 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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FOXO1Q12778 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
FOXO1Q12778 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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