Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTPRMP28827 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTPRMP28827 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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