Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-1B6SEH8 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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ERVV-1B6SEH8 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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ERVV-1B6SEH8 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
ERVV-1B6SEH8 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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