Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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DTX3Q8N9I9 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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DTX3Q8N9I9 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
DTX3Q8N9I9 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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