Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SP6Q3SY56 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms