Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
HERC1Q15751 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
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