Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SEC23BQ15437 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms