Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CBFBQ13951 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms