Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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CUL1Q13616 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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CUL1Q13616 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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CUL1Q13616 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CUL1Q13616 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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