Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CHAF1AQ13111 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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