Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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IFT88Q13099 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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IFT88Q13099 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
IFT88Q13099 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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IFT88Q13099 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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IFT88Q13099 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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IFT88Q13099 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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IFT88Q13099 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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