Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
RBBP4Q09028 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms