Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TSPOP30536 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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