Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTPRAP18433 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTPRAP18433 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTPRAP18433 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTPRAP18433 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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