Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SGCZQ96LD1 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.1 ms