Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD42Q8N9B4 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms