Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 SPIN2B-201ENST00000275988 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Q1T7F1 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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