Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms