Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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