Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms