Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms