Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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