Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SMCO1Q147U7 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SMCO1Q147U7 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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