Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN3Q13064 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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MKRN3Q13064 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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