Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms