Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms