Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHRNEQ04844 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms