Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRAP18433 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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