Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
DMDP11532 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
DMDP11532 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
DMDP11532 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
DMDP11532 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
DMDP11532 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DMDP11532 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DMDP11532 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DMDP11532 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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