Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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