Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGN3Q15651 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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