Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PDGFRLQ15198 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PDGFRLQ15198 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms