Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NFIXQ14938 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms